Euroscarf (EUROPEAN SACCHAROMYCES CEREVISIAE ARCHIVE FOR FUNCTIONAL ANALYSIS) . Euroscarf菌株保藏中心(德国Euroscarf保藏中心、Euroscarf质粒保藏中心、德国Euroscarf国际保藏单位)成立于1999年,是德国的国家酵母菌种保藏中心。该中心一直致力于酵母菌种,酵母质粒,酵母载体等的保藏工作。
Euroscarf菌种质粒保藏中心成立用于储存和运送基因组分析网络中产生的生物材料。Euroscarf酵母菌种载体保藏中心主要包括以下项目:BMBF(325 ORF)、EUROFAN I(800 ORF)和EUROFAN II,作为全球酵母基因缺失项目(6000 ORF)的一部分。如果可以获得的情况下,含有基因缺失盒或互补基因的质粒也会被储存起来。各种基因缺失菌种的遗传背景因项目而异,在很多情况下,你可以选择不同的基因背景酵母菌种。
德国酵母功能分析项目
在德国酵母功能分析项目(1994-1997)中,有325个基因被删除。15个实验室的合作致力于基因缺失和缺失菌株的功能分析(Entian等人:Mol Gen Genet 262(1999)683-702)。所有缺失菌种基因均在CEN.PK2菌株中完成。由于该项目的早期启动,大多数基因缺失是通过用营养缺陷标记替换感兴趣的基因来完成的。约三分之一的缺失是通过PCR技术进行的。由于这个原因,有各种各样的转化标记用以取代基因。从这个项目中,EUROSCARF既有交配型的单倍体菌株,也有杂合型的二倍体菌株。只有杂合子二倍体可用于必需基因。该项目产生的菌种可以通过在登录号中的前一个B,后跟一个4位数字代码和一个终端字母来识别。
Europan I 酵母基因项目
这项由115个团体组成的合作得到了欧洲联盟的支持。该项目始于1996年1月,删除并分析了800个开放阅读框。每个参与实验室负责删除和初步分析6个基因(six pack)。Wach等人已经制定了删除策略 (Yeast 10 (1994) 1793-1808)。该策略基于PCR片段来删除相应的开放阅读框架。这些缺失存在于三种不同的遗传背景中。所有的开放阅读框必须在酵母菌种FY1679的背景下删除。该菌种与S288C相同,后者是酿酒酵母基因组测序的菌种来源。除此之外,在CEN.PK2或W303中还产生了一组额外的缺失菌种,以证明基因缺失是通用的。在**阶段构建的应变由5位数字代码识别,该数字代码位于对应于应变匹配类型的加入号后面,然后是端子字母。
根据EUROFAN I项目的指导原则,所有基因敲除质粒也被收集。除此之外,大多数基因的质粒可用于缺失基因的互补。
全球基因敲除项目(EUROFAN II)
在全球范围内,欧洲和海外实验室联合在酵母菌基因组缺失项目的联合体中(Winzeler等人:Science 285(1999)901-906)。欧洲任务被称为EUROFAN II项目。所有已构建的菌株将由EUROSCARF收集。这些缺失株是在与已确定其DNA序列的酿酒酵母菌株S288c等基因的遗传背景下进行的。**阶段构建的缺失株均为副株系的遗传背景。
这些菌株的EUROSCARF登录号不同于酵母菌基因组缺失项目仅通过前一个字母Y给出的登录号。